Biztos, hogy csak ott tárolja, ahova te mondtad neki, hogy tárolja.
Viszont ha mindent kitöröltél, akkor a böngészőben mentett oldalt látsz.
Egy másik probléma, mikor localhoston tesztelsz és fel is van töltve valahova ugyanaz az oldal. Mindkét helyen garázdálkodsz, aztán összekevered, hogy éppen melyik helyen nézed, és melyik helyen változtatod a fájlokat.
(Az viszont régen rossz, ha a /var/www mappában kell bármit is csinálj, akár jól működő localhost esetén is. :-()