akronTerminálba be kell írni:
sudo dpkg-reconfigure -phigh xserver-xorg
ezt én régebbi kubuntu változatnál használtam, és ezután nekem még jobban nem működtek a dolgok mint azelőtt, akkor meg még nem volt beépítve az ubuntuba ilyen "védelmi mechanizmus", mint amit te is tapasztaltál, hogy teljesen rossz képernyő beállításoknál előjön egy beállító progi.
Ha a mostani beállítások megfelelnek, akkor szerintem mentsd el magadnak valahová a jelenlegi xorg.conf fájlodat, hogy a következő újratelepítésnél tudd, mit kell átírni benne, vagy egy az egyben kicseréled majd ezzel.