Utánanéztem pár helyen, és itt a megoldás:
http://www.debianadmin.com/debian-and-ubuntu-linux-run-levels.html
Elsőnek helyezd a scriptet a
/etc/init.d
könyvtárba, majd
update-rc.d [script neve] defaults
, és elméletileg megy.
Ha ki akarod törölni, először a
/etc/init.d
könyvtárból el kell távolítani, majd
update-rc.d [script neve] remove
.
De javítson ki valaki ha tévedek :)