Az Eclipse valahogyan mindig meg tud lepni valamilyen kellemetlenséggel, a rendszer új verzióra való frissítésekor. Ezért csak a saját könyvtáramba kicsomagolt verziót használom.
Nem lehet pl. újabb plugint hozzáadni, hiába kattintás a tovább és egyéb gombokra. Sehol semmi!
A magyarázatot és megoldást itt találtam meg: http://blog.export.be/2009/10/fixing-eclipse-for-ubuntu-karmic-koala-9-10/
Az én megoldásom:
Gnome menü szerkesztése: Fejlesztés -> Eclipse -> Tulajdonságok -> Parancs
bash -c "GDK_NATIVE_WINDOWS=1 /home/felhasználónevem/Eclipse/Eclipse.x.x/eclipse"
Ez alapján az Alkalmazások menüből lehet indítani, máshonnan nem működik.