Igen, mindenképpen a penre való GRUB telepítés lenne az ideális megoldás:
sudo grub-install /dev/sdXN
Utána a GRUB konfigurációjánál ideális lenne meghatásozni, hogy ne derítsen fel más oprendszereket:
/etc/default/grub fájlba:
GRUB_DISABLE_OS_PROBER="true"
Majd terminálba:
sudo update-grub
A számítógép BIOS/UEFI Setupjában pedig az USB-s adathordozókat kell a bootolási sorrendnél előrébb venni. Remélhetőleg ezt meglehet tenni, utána akkor ha be van dugva a pendrive az Ubuntut indítja egyből. A merevlemez MBR-jét aztán célszerű
kijavíttatni a Windows-val, hogy eltudja magát indítani.