Nyilván telepíteni kellene vagy a kernel headers csomagja(i)t, vagy meg kellene neki mutatni a telepített kernel forrását. Természetesen az előbbi megoldás az egyszerűbb, 32 bites rendszernél:
su
dpkg -i linux-headers-686
Feltételezve persze, hogy a linux-image-686 függősége által telepített kernelt használod éppen.