forfreeGondolom, nézegetted már programok beállításait. A Hang és Videó beállításokat javasoltam és az ablak alján van egy alapértelmezettre visszaállítás rádiógomb is.
Az Ubuntu a Pulse hangrendszert használja egy ideje, nálam is véletlenül ez van telepítve (kivéve, nekem két hangszóróm van):
http://imageshack.us/photo/my-images/189/vlchangpulse.png/
A Videókimenetek (a videó megjelenítők) széles tárháza áll rendelkezésedre, kérdés, hogy telepítve vannak-e és melyikre van szükséged (nem kell és nem is lehet mindegyiket telepíteni). Az alapértelmezett beállítás jó lehet (vagy az említett x11 ... is, de más is:
http://imageshack.us/photo/my-images/585/vlcvidekimenetek.png/
A videókártyád és drivere szerint további beállítások lehetnek szükségesek, erre a kereső segítségével találsz rá. Feltételezem, ha telepítettél drivert és tudod milyen videókártyád és milyen hardvereid (géped) vannak, akkor a keresőszavak adottak. Vagy leírod milyen hardvereid vannak, videókártya, gép (processzor, alaplap, desktop vagy notebook), stb. és milyen op.rendszert használsz éppen, pl. Kubuntu 12.04 64bit (bár lehet ezt írtad, most nem nézem meg).
Ha figyelmesen megnézed a képeket, láthatod a VLC beállításokban a "Mind"-re klikkeltem.