Egyszer ugye van a Flacon: http://code.google.com/p/flacon/ https://launchpad.net/~flacon/+archive/ppa (http://www.webupd8.org/2011/12/lossless-audio-split-tools-updates.html) De most épp ape-ről van szó, ez monkey's audio egyébként. Lehetett volna blog is, de egy dologra nem jövök rá. Nemrég kezdtem az ismerkedést a megoldással, és a mai napra befejezem. Két parancs: 

cuebreakpoints *.cue | shnsplit -o flac *.ape ;
cuetag *.cue split-track*.flac ; ;
Értelemszerűen az első parancsban *.cue és a *.ape helyett az eredeti fájlokat elérési útjukkal kell beírni és az elérési utat érdemes idézőjelek közé is tenni. Példa: '/media/ADAT/Zene/Előadó/zene.cue' A második parancsban a split-track*.flac nevet nem kell behelyettesíteni értelemszerűen, a *.cue elérési utat viszont igen. Fenti megoldás tökéletes az ID tag-ekre (MediaInfo mutatja), de a számok fájlkezelőben szereplő, látható neve "nem stimmel". 
man shntool
Innen valami sejlik, de nem találtam még rá, hogy' kéne (Tipp: %F, stb. ...). Erre keresek megoldást főképpen. Esetleg szkriptre, mert az már "program" lenne :). (másik cél a DVD Audio készítés, így merült fel ez is, összekötve) Tudásbázis: http://www.webupd8.org/2009/04/split-ape-and-flac-files-in-ubuntu-and.html http://en.linuxreviews.org/HOWTO_splitt_lossless_audio_files_%28ape,_flac,_wv,_wav%29_using_.cue_files https://wiki.archlinux.org/index.php/APE%2BCUE_Splitting https://bbs.archlinux.org/viewtopic.php?id=75774 http://gimpel.gi.funpic.de/wiki/index.php?title=Howto:convert_ape_to_wav/mp3/ogg_on_Linux A linkeken más formátumra is van leírás és a kimenetre is (lehet kombinálni). Alábbi megoldás az ID tag-ek tekintetében nem vált be (nulla eredmény): http://technoergonomics.com/articles/2011/12/converting-audio-file-formats-ape-cue-flac-linux
___ Megoldás: Másodszor is Flacon (APE fájlokat is kezel) A legjobb minőséget állítottam be mindenhol, ennyi a teendő a "Beálítások"-ban. A címből már kivett "egy rész kérdéses", az kérdéses marad (számok, azaz fájlok neve), de nem kívánok foglalkozni vele. És a Flacon OGG formátumba is konvertál: http://ubuntu.hu/node/23013 A példánál maradva, a CUE felhasználásával FLAC-ba, OGG-ba konvertál, a szabdalással együtt, éppen APE-ba nem :), de sok másba igen. Csak le kell ellenőrizni. A Flacon PPA-ról telepítése előtt (Debian alatt) el kell távolítani a monkeys-audio csomagot, a mac csomag megy a helyére a PPA-ról. OGG-ba konvertálásra ott a rendkívül jó XCFA. Debian, Ubuntu alatt tárolóból telepíthető, amúgy: https://www.google.com/search?q=XCFA

Ennyivel később: 9 év