DragHa te nem formázod meg előtte a partíciót Custom módban, akkor helyetted nem fogja megtenni senki sem.
És bizony a linux annyira okos, amennyire az üzemeltetője. A linux mindent megcsinál amit mondasz neki. Ha hülyeséget mondasz neki, azt is megcsinálja, tekintve hogy linux esetében (jó esetben) te irányítod a rendszert és nem megfordítva.
Tehát, problémád orvoslására egy alternatív megoldás: Win XP telepítése egy adott partícióra, majd ubuntu telepítése (2-3 esetleg 4 (swap; /; /home; esetleg /boot)) win XP által NEM lefoglalt másik partíciókra, amelyeken ELŐZETESEN kialakítottál ext3-vagy ext4 fájlrendszert. Swapnek persze swap fájlrendszer az ajánlott. Már persze ha szeretnél magadnak olyat.