Szia!
Nem kell vírusírtó, de tűzfal ajánlott. Ezt jól tudod, de nem PHP.
Ezen mi nem sikerül? http://ubuntu.hu/konyvlap/alap-tuzfal-otthoni-pc-re-iptables
Írd le, és módosítom, ha nem egyértelmű, hogy rövid és okos legyen :)
FTP-s program: (menü)Helyek/Kapcsolódás szerverhez, mc, krushader (TC szerű), filezilla, gftp-gtk