Semmi gondod nem adódik abból, hogy két elsődleges partíció létezik a merevlemezen. Ezekből max. 4 létezhet egy lemezen, a többinek kiterjesztettnek kell lenni.
Win7 telepítőjét nem ismerem, de ha módosítani szeretnéd a partíciókat, szerintem bootolj egy live Ubuntu-t, és ott Gparted segítségével alakítsd ki a megfelelő partíciókat. Továbbá Ubuntu-t nem raknék NTFS-re, és készítenék egy partíciót a /home számára is, hogy esetleges újratelepítés után a beállítások, fájlok megmaradjanak.
szerk.: itt olvashatsz némi infót (elég tömör, de ennyi elég szerintem, ha jobban érdekel a dolog úgyis találsz rengeteg irodalmat)