kukimukiHa nem fut a compiz (terminálban a ps aux | grep [c]ompiz parancs nem ad ki semmit), akkor Unity 2D megy nálad, a bejelentkezésnél a fogaskerék alatt nézd meg, hogy Ubuntu és ne Ubuntu 2D legyen beállítva, és akkor meg fogja próbálni automatikusan elindítani. Ha nem megy neki, és a compiz --replace belassítja a rendszert, akkor a videokártya körül lesz valami gubanc, milyen kártyád és milyen driver van telepítve?
A checkgmail nálam működik, a whitelistben 'Checkgmail' érték szerepel (all-ra nem működik, és az all-t amúgy is ki fogják venni a 12.04-ből), ki- és bejelentkezés után (mert Unity 2D-n nem működik a unity --replace) megjelenik az ikon. Maga a program csak akkor működik, ha megpatchelem, mert a tárolóból szedett verzió hibás felhasználónévre panaszkodik.
A Transmissionnel kapcsolatban nem tudom, hogy csak itt írtad el, vagy rossz paranccsal próbálkoztál, de a grafikus transmission kliens nem a transmission-gui, hanem a transmission-gtk paranccsal indul (így írtam fent), és szintén működnie kell (mindenféle whitelist beállítás nélkül, mert ez rendes indikátor).