Az teljesen mindegy szerintem, hogy Ubuntu-val vagy Windows-al használod, az NTFS-re formázott dolgok töredezni fognak, mert ez a fájlrendszertől függ és nem az operációs rendszertől. Ha biztosan csak Linux-ot akarsz használni, akkor megéri, hogy ext3-ra formázd újra, mert sokkal barátságosabban fog viselkedni, gyorsabb is lehet szerintem, és persze egy újratelepítésnél nem kell azzal szórakozni, ha nem csatolja az ntfs cuccokat a rendszer (amit én még ugyan nem tapasztaltam, de előfordulhat).
