phareNa, válaszolok én is, kiegészítem kicsit szponzor hozzászólását, illetve újat is mondok.
A Kubuntu csomagkezelője a KPackageKit, amelyet a Kickoff alkalmazásindító → Alkalmazások → Rendszer → Szoftverkezelés (KPackageKit) kiválasztásával lehet indítani.
A Firestarter GTK-s alkalmazás, lehet használni nyugodtan KDE környezetben, de ha KDE-s program kell, akkor a Guarddogot érdemes megnézni.
Fájlkezelőnek a szponzor által is említett Krusadert tudom ajánlani, valamint ott van a Dolphin, ami ugyan nem kétpaneles, de lehetőség van benne a Firefoxhoz hasonlóan fülek használatára.
Mint már említettem, nyugodtan használhatsz GTK-s programokat KDE környezetben, kifejezetten KDE-s FTP programot nem tudok, én a FileZillát használom.
A VLC természetesen működik, ráadásul Qt-s alkalmazás, ami azt jelenti, hogy tökéletesen integrálódik a KDE környezetbe, mivel a KDE is Qt keretrendszerre épül.
Ezen a ponton kiigazítanám mindkettőtöket. Grafikus alkalmazásokat ajánlott gksu (Ubuntu illetve Xubuntu alatt) illetve kdesudo (Kubuntu alatt) parancsokkal indítani, ha rendszergazdai jog szükséges. Tehát ha a Dolphin fájlkezelőt akarod elindítani, akkor a kdesudo dolphin parancsot kell kiadnod. A Krusader esetén egyszerűbb a dolog, a KDE menüből indítható rendszergazda módban is, a Rendszer almenüből.
Remélem elég kimerítő választ sikerült adni.