zemataroSudo esetében ha grafikus alkalmazást indítasz, akkor az közvetlen használja a felhasználó .Xauthority fájlját. Amit azért tesz, mert a felhasználó futtatja a grafikus felületet, és neki ahhoz, hogy az ablakot megjelenítse, szüksége van erre a fájlra. Viszont ha ennek a fájlnak a tulajdonosa átvált rootra, akkor utána nem tudsz grafikusan bejelentkezni. A gksu(do) pl. annyit tesz, hogy átmásolja a nevezetes fájlt a /tmp könyvtárba, és azt mutatja meg a grafikus alkalmazásoknak. Azok meg azt tehetnek vele amit akarnak.