A kérdés tehát adott.
Ha lehetséges olyan progi kéne (ha létezik) ami mondjuk drag and drop megoldással működik, és ki is egyenlíti a különbségeket a fájlok között, de persze az sem baj ha nincs ilyen egyszerű megoldás Linux alatt, a nehezebbel is megbirkózom.
A válaszokat előre is kösz! :)
UPDATE:
Audacity a megoldás, pedig előtte gugliztam rendesen mégsem találtam gyógyírt.
Köszönöm Araya-nak.